환자는 프로바이오틱스가 함유된 건강식품을 자주 복용하면 설사 예방과 치료를 할 수 있다. 정상인의 장에는 500 여 종, 수억 종의 다른 세균이 서식하고 있다. 대부분의 경우, 그들은 서로 제약하고 번창한다. 장균군의 균형이 깨지면 설사 현상이 발생할 수 있다. 둘째, 항생제 남용도 설사 유발. 유럽의 일부 의학센터에서는 유산균, 비피더스, 국분을 주성분으로 한 구강 액을 사용해 여행자 설사 치료에 좋은 효과를 거두었다.
프로바이오틱스의 또 다른 기능은 질 감염을 예방하는 것이다. 유럽의 이중 맹검 통제 실험 (질 곰팡이 감염사를 가진 46 명의 여성이 실험에 참여한 것) 이 이를 증명했다. 모든 여성 환자는 매일 대량의 프로바이오틱스가 함유된 요구르트 150ml 을 경구 복용한다. 그 결과, 질 감염의 발생률은 플라시보 그룹의 여성보다 훨씬 낮다. 요구르트에 들어 있는 유산균이 질 내 백색 염주균의 번식을 억제할 수 있기 때문이다.
과학자들은 장내 프로바이오틱스의 증식이 인체의 전신 면역력을 촉진하고 높일 수 있다고 생각한다. 카프카스 산간 지방이나 지중해 연안 국가들과 같은 유럽의 유명한 장수 마을에서는 당뇨병, 심혈관 질환, 비만에 거의 걸리지 않는 수제 요구르트를 자주 마신다. 요구르트에 대량의 프로바이오틱스가 함유된 것과 관련이 있다는 연구결과가 나왔다. 1970 년대부터 1990 년대까지 외국의 많은 실험들은 프로바이오틱 음료를 마시면 혈청 콜레스테롤을 낮출 수 있다는 것을 증명했다. 최근 일부 외국 학자들은 매일 200ml 의 산유균과 국화가루로 발효된 요구르트를 마시면 고지혈증 환자의 혈지를 평균 4.4% 정도 낮출 수 있다는 논문을 발표했다. Lactobacillus acidophilus 와 이눌린 모두 지질 강하 효과가 있기 때문이다.
또 프로바이오틱스를 장기간 많이 마시면 암과 종양질환을 예방하고 골질 손실과 골다공증을 예방할 수 있다는 연구결과도 나왔다.