負責文秘工作、政務信息、督查、會議、保密、信訪、統計、檔案、幹部保健、接待和管理車輛及辦公用品等工作。負責起草、審核綜合文件和報告，參與和指導調查研究，組織新聞發布；制定全省司法行政中長期發展規劃和年度工作計劃並監督實施。
辦公室下設秘書科、行政科、信訪科、信息監督科和綜合科。
②政治部
指導和監督司法行政系統的隊伍建設、思想政治工作、組織宣傳、表彰獎勵、黨的建設和精神文明建設；承擔部直屬單位和監獄、省勞教所領導班子建設的具體工作，負責所轄直屬幹部的考察、考核和任免等相關工作；協助州（市）司法局和州（市）勞教領導幹部，考核協管幹部，提出任免和交流建議；負責機關及直屬單位的機構設置和人事工作；負責司法行政系統警務管理、警銜評定和獎勵、人民警察撫恤和警銜獎勵（晉升）培訓工作；負責全系統警務紀律管理和警務督察工作，負責機關和司法行政系統幹部教育培訓工作；指導直屬事業單位工作。
政治部下設三個部門（正處級）:
1.幹部處
2.人事警察部隊（警察督察隊）
3.組織培訓部
（3）法律事務部（行政復議辦公室）
組織起草與司法行政相關的地方性法規、政府規章和規範性文件，參與法規修訂、論證等立法工作；負責司法行政系統的法制建設，監督檢查司法行政法律、法規和規章在全系統的實施情況，組織監督司法行政機關的行政復議、行政應訴和國家賠償工作；負責仲裁機構的登記；負責辦理NPC代表建議和CPPCC提案。
（四）法制宣傳處（雲南省委依法治省和法制宣傳教育工作領導小組辦公室）
指導和監督普法、依法治理和法制宣傳教育；制定並組織實施普法、依法治理和法制宣傳教育的中長期和年度計劃；組織和指導法制宣傳報道；負責司法行政系統的宣傳工作。
⑤計劃財務裝備部
制定司法行政系統基本建設、經濟發展和社會事業的規劃；指導和管理司法行政系統重大基本建設項目的論證、評估、審查、申報和實施工作；制定司法行政系統財務、物資和技術裝備管理的規章制度；負責機關及直屬單位預決算、財務管理、政府采購和國有資產管理工作；負責司法行政系統槍支彈藥、服裝、車輛、警械等後勤物資裝備管理工作；指導和監督司法行政系統業務經費、中央政法補助專項經費和政府采購；指導和監督監獄、勞動教養系統行政事業經費使用和國有資產保值增值工作。
⑹律師事務所
指導和監督律師、法律顧問和社會法律咨詢服務機構的工作；組織實施律師工作法律法規；負責律師執業審核、律師工作機構設置審批，管理在雲南設立的外國（境外）律師機構和外國律師事務所分支機構；負責律師事務所及其執業律師的年度考核、獎勵、職業道德建設和行政處罰；聯系雲南省律師協會。
（七）律師行業執法監督辦公室。
負責律師行業執法執紀監督；監督律師事務所和律師執行《律師法》及相關行業規範和行業管理政策，對律師事務所和律師的執業活動進行指導、監督和檢查；受理對律師事務所和律師的投訴並調查處理；參與組織和指導律師涉法信訪工作，加強對律師代理影響較大案件的指導和監督；依法參與實施對律師事務所和律師違法違紀行為的行政處罰。
⑻公證處
指導、監督和規劃公證工作；組織實施公證規章制度；負責公證資格管理、公證機構設置審批、公證員執業審批、公證員和執業公證員年檢和註冊；監督和指導公證業務活動，監督公證質量；負責公證員的考核和培訓；開展與國外及港澳臺地區公證機構和人員的業務交流與合作；聯系雲南省公證協會。
⑼基層工作辦公室
指導和監督基層司法行政機構、人民調解、司法助理和基層法律服務所；會同人民法院指導人民陪審員工作；聯系雲南省人民調解員協會。
（十）社區矯正工作管理辦公室
組織協調社區矯正工作；加強社區矯正執法隊伍和誌願者隊伍建設；研究社區矯正法律政策，探索實施社區矯正新方法；負責社區矯正工作的宣傳和對外交流。指導和監督刑滿釋放和解除勞動教養人員的安置教育工作；承擔雲南省社會治安綜合治理穩定委員會退役軍人安置教育工作領導小組辦公室具體工作。
（十壹）國家司法考試辦公室
負責國家司法考試的組織、實施和監督；負責國家法律職業資格證書及其持有人的管理工作；負責司法考試的發展規劃、培訓、交流和宣傳；制定在職司法警官和企業法律顧問的法律教育培訓計劃並組織實施；指導成人法律教育並負責培訓專業人員。
（12）對外交流合作辦公室
負責司法行政涉港澳臺具體事務；負責國際對口司法交流；參與人權問題的國際法律討論和交流；組織和參加司法和法律領域的多邊和雙邊交流活動，研究外國司法制度和司法實踐；開展政府與民間的法律交流與合作；承辦司法行政系統的涉外事務。
審計辦公室
指導和監督司法行政系統內部審計工作；負責機關及直屬單位內部審計和司法行政系統負責幹部經濟責任審計；負責法律服務機構的年度註冊審核；負責司法行政系統審計人員的管理和培訓；負責司法行政系統相關事項的專項審計。
司法鑒定管理
制定司法鑒定發展規劃和改革發展政策，制定並組織實施司法鑒定管理規定和技術規範；負責司法鑒定機構和司法鑒定人的審查登記、名冊編制和名冊公告；負責司法鑒定機構資質管理評價、司法鑒定質量管理評價和司法鑒定人信用等級評價；指導和監督司法鑒定機構和司法鑒定人，處罰其違法違紀行為；指導和監督面向社會的司法鑒定人的資格管理、質量管理和專業教育培訓工作；聯系雲南省司法鑒定協會。
（十五）法律援助管理局（“148”工作指導辦公室）
指導和監督法律援助工作，規劃法律援助發展布局；制定並實施法律援助工作的相關規章制度；受理影響較大的法律援助案件，指派執業律師等法律服務人員辦理法律援助事務；指導和監督法律援助機構、法律援助工作者、社會組織和誌願者開展法律援助工作；負責籌集和管理法律援助資金；組織指導“148”法律服務和法律援助專用電話的建設和服務；負責組織對外法律援助的交流與合作；負責法律援助工作的宣傳。
法律援助管理局下設綜合科、援助事務科和業務指導科。
（16）雲南省勞動教養管理局（雲南省戒毒管理局）
編制勞動教養中長期和年度計劃並監督實施；負責勞動教養場所的行政管理、教育矯治、安全保衛和警械配備；規劃勞動教養場所的布局、新建、改擴建、遷移、撤銷和合並並組織實施；管理勞動教養場所的生產、基建、財務、國有資產、土地資源、安全環保等工作；負責勞教系統幹警隊伍建設和思想政治工作，負責勞教系統紀檢監察和內部審計工作。
雲南省勞動教養管理局（雲南省戒毒管理局）下設9個處（副處級）和政治部（正處長級）:
1.辦公室，設有綜合部和行政部。
2.政治部（警務督察支隊）下設組織人事科和宣傳教育科。
3.財政部
4.行政辦公室
5.教育和矯正司
6.生命健康部
7.藝術部門
8.場地規劃辦公室
9.後勤支援部
10.監督審計局
黨委
負責機關及直屬單位黨群工作。
檢查辦公室
負責機關及直屬單位的行政監督工作。
退休人員辦公室
負責機關及直屬單位離退休人員工作。