준설 효과를 보장하는 중요한 부분 중 하나는 버려진 흙을 처리하는 것이다. 발굴된 진흙과 모래가 해구로 되돌아갈 수 없도록 하여 인공퇴적을 초래하고, 인접한 항로와 항구에 영향을 미치지 않도록 해야 한다. 폐토의 처리 방법은 크게 두 가지 범주로 나눌 수 있다. 즉, 물에 쏟아지는 것과 진흙을 보내 상륙하는 것이다. 내륙 하천 공사에서 물에 덤핑하는 것은 폐토로 딩댐, 순댐 등을 채워 건물을 정비하는 제방 (정비 공사 참조) 이나 깊은 담에 덤핑하는 것이다. 하구, 항만의 얕은 물 건설에서는 인공섬이나 간척지를 폐토로 채우는 경우가 많기 때문에 먼저 제방을 쌓아 폐토의 손실을 방지해야 한다. 깊은 물 투기는 보통 공해에서 진행된다. 진흙이 상륙할 때는 좋은 개간지를 선택해야 하며, 주로 해안경사의 안정성과 배설량을 고려해야 한다. 강을 따라 바다를 메우고 땅을 개간하는 것은 수로의 안정에 영향을 미치지 않을 수 있으며, 대부분 먼저 건설되고, 높은 해안은 진흙 펌프 파이프를 메운다. 폐기 처분 방식의 선택은 준설 공사의 전반적인 요구에 따라 지방조건에 따라 경제적 합리성을 비교해야 한다.