(1) 유전자 변형 식품은 우리가 먹는 음식의 자연적 특성을 변화시켰다. 그것이 사용하는 생물물질은 인간의 식품 안전이 제공하는 부분이 아니며, 오랜 테스트를 거치지 않으면 인체에 큰 건강 위험을 초래할 수 있다.
(2) 유전자 조작 식품은 예측할 수 없는 생물 돌연변이를 일으켜 식품에 더 높은 함량과 새로운 독소를 생산한다.
(3) 알레르기 또는 알레르기 반응: 유전자 기술은 음식에 예측할 수 없고 알 수 없는 알레르겐을 만들어 낸다. 과학자들은 브라질 호두의 특성을 콩에 이식했지만, 그 결과 호두에 알레르기가 있는 일부 사람들은 콩을 먹은 후 알레르기 반응을 보일 수 있다.
(4) 유전자 조작 식품은 식품의 영양가를 낮추거나 식품의 중요한 성분을 분해한다. 미국의 연구결과에 따르면 제초제 내성 유전자를 가진 콩에서는 이소플라본 등 항암 성분이 줄어든 것으로 나타났다. 유전자 조작 식품의 허위 신선함이 소비자를 현혹시켰다. 광택이 나는 붉은 토마토는 몇 주 동안 보관할 수 있지만 영양가는 매우 낮다.
(5) 유전자 변형 기술은 항생제 내성 유전자를 이용하여 유전자 변형 작물, 즉 작물이 항생제 내성 유전자를 가지고 있다는 것을 확인한다. 이 유전자들은 세균을 통해 우리에게 영향을 미친다. 영국의 연구에 따르면 유전자 변형 작물의 돌연변이 유전자가 생물에 들어갈 수 있으며 그 결과 새로운 질병이 발생할 수 있다. 비슷한 결과가 인간과 동물에게 일어난다면 항생제가 죽일 수 없는 가장 강력한 슈퍼박테리아를 재배할 수 있다.
(6) 부작용은 치명적일 수 있다: 메이노, A.N 등 (1994) 은 새로운 원인 불명의 질병이 발생했다고 보도했다. 주로 산성근통으로 나타났다. 임상증상 중에는 마비, 신경 문제, 통증 붓기, 피부 가려움, 심장 문제, 기억력 감퇴, 두통, 광감도, 수척함 등이 있다. 나중에 일본의 한 회사에서 생산한 유전공학균이 생산한 트립토판이 발견되었다. 3 개월 후, 식자가 아파서 37 명이 죽고 1, 500 명이 부분적으로 마비되었고, 5,000 여 명이 가끔 허약했다.
(7)2007 년 프랑스 과학자들은 맹산도가 생산한 유전자 변형 옥수수가 인체 간과 신장에 독이 있다는 것을 확인했다.