몇 년 동안의 고속 발전을 거쳐 차세대 염기서열분석기가 마침내 느려졌다. 오늘날 샘플 준비는 이미 NGS 의 새로운 포인트가 되었다. 시간을 단축하고 플럭스를 높이기 위해 새로운 시약 및 도구가 계속 등장합니다. 이와 동시에 단세포와 같은 더 적은 샘플을 처리하기 위한 새로운 방법을 지속적으로 개발하고 있다. 이번에는 Biolink 가 NGS 샘플 준비 센터로 안내하여 샘플 준비 문제를 해결하는 데 도움이 되는 새로운 도구가 있는지 알아보겠습니다.
각종 테스트 키트 가 있다 해도 NGS 샘플 준비 는 여전히 고통스러운 과정 으로 시간 과 노력 이다. 고 처리량 실험실을 위해, 그런 종류의 노력, 이 봐, 당신은 알아요. 그 결과, 사람들은 고급 대기의 상급을 위한 자동 준비 플랫폼으로 눈을 돌렸다. (윌리엄 셰익스피어, 오페라, 희망명언) 이 기기들은 우리를 번거로운 수작업에서 구해낼 뿐만 아니라, 인간의 실수도 줄일 수 있다. 그래서 가격이 높지만 그만한 가치가 있습니다.
현재 시장에 이미 많은 회사들이 베크만 쿠르트와 퍼킨 엘머 (카자) 를 포함한 자동화 샘플 준비 플랫폼을 내놓고 있다. 물론, 음순기 제조업체도 뒤처지지 않고 잇달아 자신의 배합 플랫폼을 내놓았다. 올 2 월, Illumina 는 AGBT 회의에서 key-press NeoPrep 라이브러리 준비 시스템을 발표했습니다.
베크만 쿠르트
Beckman Kurt 의 NGS 라이브러리 준비 솔루션에는 Illumina 게놈 분석기, 로스 GS FLX 및 Life Tech SOLiD 시스템에 대한 Spriworks 단편 라이브러리 시스템 I-III 가 포함되어 있습니다. 또한 Illumina 용 NGS 플랫폼인 고통 SPRIworks HT 시스템도 도입되었습니다.
SPRIworks System I-III 는 특허 기반 고체상 가역 고정화 (SPRI) 기술로 4-5 시간 이내에 최대 10 개 샘플의 라이브러리 준비를 완료할 수 있습니다. 이 시스템은 SPRI-TE 핵산 추출기, 액체 처리를 제어하는 방법 카드, 라이브러리 준비에 필요한 모든 시약 테스트 키트 등 세 부분으로 구성되어 있습니다. 실험에 필요한 모든 시약, 흡두, 시험관이 제공되므로 샘플과 커넥터만 준비하면 됩니다. SPRIworks 시스템은 기둥 순화 및 젤 전기 수영 없이 최종 복구, 꼬리 추가, 커넥터 연결, 크기 선택 및 순화의 네 가지 주요 단계를 자동화합니다.
SPRIworks HT 시스템은 베이커맨 쿠르트의 Biomek 을 기반으로 합니까? FXP 랩 자동화 워크스테이션. SPRIworks I-III 와 동일한 기능을 제공할 뿐만 아니라 PCR 체계의 설립, 정제, 표준화 및 샘플 병합도 가능합니다. 물론 다양한 옵션 액세서리를 통해 DNA 전단과 PCR 도 가능합니다. 6 시간도 채 안 되어 96 개의 샘플을 처리할 수 있으며, 크기 선택을 없애면 3 시간밖에 걸리지 않습니다. 크기 선택도 여러 가지가 있습니다: 150-350 BP, 250-450 BP, 350-700 BP. SPRIworks HT 는 그래픽 사용자 인터페이스를 채택하여 사용이 매우 간단하다.
퍼킨 엘머 (캘리퍼스)
Caliper 는 칩 랩 기술의 선두주자로서 자동화 분야에서 풍부한 경험을 가지고 있습니다. 최근 몇 년 동안, 그것은 또한 NGS 상류 하류에서 많은 혁신적인 제품을 내놓았다. 20 1 1 년 9 월, Caliper 는 PerkinElmer 에 인수되었고, 지난해 그들은 공동으로 NGS 급행열차를 선보였다. 워크스테이션.
이것은 Ion Torrent PGM 과 같은 데스크탑 시퀀서에 적합한 작고 유연하며 사용하기 쉬운 라이브러리 준비 시스템입니다. 그리고 Illumina 의 MiSeq 시스템도 있습니다. 이 제품에는 완전한 NGS 샘플 준비 응용 프로그램 패키지가 포함되어 있어 이미 실천 검증을 거쳤다. 따라서 초보 사용자도 안정적이고 고품질의 문고를 쉽게 얻을 수 있어 시퀀싱 데이터의 품질을 보장할 수 있습니다. 물론 숙련된 사용자도 사전 설정된 응용 프로그램을 수정하여 개인의 요구를 충족시킬 수 있습니다.
NGS 택배 어플리케이션에는 그래픽 조작 인터페이스와 단계별 설정 마법사가 포함되어 있어 어플리케이션 선택, 샘플 수 확인, 실험 제품 배치 등 가장 직관적인 지침을 그래픽으로 제공합니다. 시스템 플럭스는 유연하고 배치당 1-24 개의 샘플을 처리할 수 있어 주문형 검사와 최소 실험 주기를 보장합니다.
이와 함께 PerkinElmer 는 HiSeq 와 같은 고통 측정순서 플랫폼을 위한 Sciclone NGS 워크스테이션을 개발했습니다. 이 기기는 라이브러리 준비, 시퀀스 캡처 및 표준화를 실현하여 mRNA-Seq, 칩 -Seq 등의 어플리케이션에 적합합니다. 실행당 8 ~ 96 개의 샘플을 처리할 수 있으므로 매주 480 개의 문고를 준비하거나 192 개의 현자를 캡처할 수 있습니다. 또한 퍼킨 엘머는 핵산의 정량 및 품질 관리를 위해 가장 비용 효율적인 제파 NGS 워크스테이션, 포스트 PCR 워크스테이션, LabChip DS 및 LabChip GX 를 제공합니다.
인메나
올해 AGBT 대회에서 Illumina 는 NeoPrep 문고 준비 시스템도 발표했다. Illumina 웹 사이트에 따르면, 이 기기는 디지털 마이크로흐름 제어 기술을 사용하여 키 라이브러리 준비를 실현합니다. TruSeq 및 Nextera 라이브러리 준비 프로세스를 크게 단순화할 수 있습니다. 더 적은 단계, 더 적은 오류 기회, 이는 더 많은 반복성을 의미합니다.
NeoPrep 은 또한 Illumina 의 게놈 컴퓨팅 환경인 BaseSpace 와 통합되어 샘플 준비부터 시퀀싱, 분석에 이르는 원활한 프로세스를 제공합니다. NeoPrep 는 매번 실행될 때마다 16 개의 시퀀싱을 준비하는 문고를 가져올 수 있으며, 일부 샘플은 1 ng 로 낮아진다. 첫 번째 NeoPrep 테스트 키트 배치는 TruSeq PCR-free 와 TruSeq Nano, 그 다음은 다른 TruSeq 및 Nextera 테스트 키트 등이 될 것입니다. 이 악기는 올여름에 출시될 예정이다.
물론 신제품은 아직 출시되고 있습니다. AGBT 컨퍼런스에서 GenCell Biosystems 는 완전히 통합되고 자동화된 데스크탑 라이브러리 준비 시스템인 CLiC LP 를 출시했습니까? 。 이 기구는 GenCell 의 복합 액체 배터리 (CLC) 기술을 채택하여 모든 반응을 기름에 밀봉하여 자연 세포 구조를 시뮬레이션함으로써 플라스틱 소모품을 절약하고 시간과 비용을 절약했다고 소개했다. 가까운 장래에, 나는 우리가 더 나은 선택을 할 것이라고 믿는다.