2 행정 엔진의 단점은 발열이 빠르고, 기름 소비가 높으며, 엔진 부품이 마모되고, 느리고 불안정하며, 기름 소비가 높고, 배기 오염이 심하다는 것이다. 지금은 소수의 프로 경주용 자동차나 특수한 소형 배기차를 제외하고는 2 행정 엔진이 거의 사용되지 않는다.

그러나 2 행정 역시 무가치한 것은 아니다. 작은 크기, 간단한 구조, 저렴한 비용, 폭발력, 동력 수출이 원활하다는 장점이 있어 체인톱 등 일부 소형 범용 제품에 사용되고 있다.