비밀 특허 출원은 국가 안보나 국방이익 이외의 중대한 이익을 포함해 비밀이 필요한 발명이나 실용 신안 특허 출원을 말한다. (알버트 아인슈타인, Northern Exposure (미국 TV 드라마), 비밀명언)

국방특허 신청은 국방지식재산권국이 접수하고 심사하며, 국가지적재산권국이 접수한 국방이익 관련 특허신청은 국방지식재산권국으로 이송해 심사한다. 국가지식재산권국은 기밀 특허 신청을 접수하고 심사한다.