특별 자선기금 설립은 재단이 기업사업단위와 자선가를 동원하여 자선사업에 참여하는 중요한 방법이다. 특별 기금이 기증자에게 매력적인 한 가지 중요한 이유는 기증자가 특별 자금의 이름을 정하고 높은 관리 권한을 가질 수 있기 때문이다.
특별 기금은 대중과 여론의 민감한 지점이며, 많은 재단들이 특별 기금 문제에 위기를 겪고 있다. 규정 준수와 투명성을 보장하기 위해, 특별 자금은 다음과 같은 방면에서 관리해야 한다. (1) 정보 공개 및 (2) 특별 감사. (3) 프로젝트 평가.