녹조수화는 주로 질소인을 과다하게 강이나 호수로 배출하고, 수체 부영양화로 인해 녹조수화를 일으킨다. 농토 화학 비료의 과다 사용은 수질 오염의 중요한 면원 오염이다. 하지만 농지에서 화학비료를 사용하는 것은 단지 요인 중 하나일 수 있으며 공장 오수, 생활폐수 등 기타 오염된 수역이 있는지 여부도 고려해야 한다.