메탄올은 독성이 강하여 인체의 신경계와 혈액계에 가장 큰 영향을 미친다. 소화관, 호흡기 또는 피부 섭취 후 독성 반응이 발생하며, 메탄올 증기는 인체의 호흡기 점막과 시력을 손상시킬 수 있다. 급성 중독의 증상으로는 두통, 메스꺼움, 위통, 무기력, 시력 흐림, 실명, 호흡곤란 등이 있으며, 결국 호흡기 중추마비로 사망한다. 만성 독성 반응은 현기증, 졸음, 두통, 이명, 시력 저하, 소화기 장애 등이다. 메탄올 섭취량이 4g 를 넘으면 중독 반응이 일어난다. 작은 메탄올 한 잔이 10g 를 잘못 초과하면 실명과 사망을 초래할 수 있다. 치사량은 30 밀리리터 이상이며, 메탄올은 체내에서 쉽게 배출되지 않고 축적되어 체내에서 산화되어 생성된 포름알데히드, 포름산도 독성이 있다. 메탄올 생산 공장에서 우리나라 관련 부서는 메탄올의 공기 중 허용 농도는 50mg/m3 이며, 메탄올가스가 있는 현장에서 근무할 때는 방독면을 착용해야 하며, 폐수를 처리한 후에야 배출할 수 있다. 허용 함량이 200mg/L 미만이다. 메탄올의 중독 메커니즘은 메탄올이 인체 대사에 의해 포름알데히드와 포름산 (일반적으로 포름산) 을 발생시켜 인체에 해를 끼친다는 것이다. 흔히 볼 수 있는 증상은 한 시간, 몇 시간 후에 술에 취해 두통, 메스꺼움, 구토, 시력이 흐려지는 것이다. 심할 때, 사람은 실명하고, 심지어 사망할 수도 있다. 실명의 원인은 메탄올의 대사산물 포름산이 눈에 축적되어 시각신경세포를 파괴하기 때문이다. 뇌신경도 손상을 입어 영구적인 손상을 입힐 수 있다. 포름산이 혈액에 들어가면 조직이 점점 산성화되고, 산성 물질은 신장 배설 장애로 인해 체류한다. 산중독은 요독증의 가장 흔한 사망 원인 중 하나로 신장을 손상시키고 신장부전을 일으킨다. 통풍을 강화하여 가능한 한 빨리 증발해야 한다.