商品雏鸭首先应根据种鸭的免疫情况注射疫苗。可在1日龄注射小鸭病毒性肝炎疫苗，在7～10日龄注射禽流感疫苗。除此之外，在我国南方鸭瘟高发地区，肉鸭（包括肉用的种公鸭）应在20日龄左右注射鸭瘟疫苗。另外，建议给肉鸭注射品质良好的传染性浆膜炎疫苗和大肠杆菌病疫苗。