tac 클로닝 후 DNA가 상대적으로 순수한 이유
클로닝 및 PCR부터 게놈 서열 분석 및 칩 분석에 이르기까지 다중 분자 생물학 및 유전체학 응용 분야에서는 DNA 정제가 필수입니다. 그러나 최고의 정화 키트를 선택하는 것은 쉽지 않습니다. 예를 들어, genomic DNA를 정제할 때 플라스미드 DNA를 분리하지 않고 핵산을 부드럽게 처리하는 키트가 필요합니다. 더욱이 차세대 시퀀싱 기술은 샘플에 대한 요구 사항이 매우 높으며 DNA를 정제하려면 특수 제품도 필요합니다. 여기서는 몇 가지 새로운 옵션을 소개합니다.
염분 침전 방법
Epicentre(Illumina 회사)의 MasterPure® Complete DNA Purification Kit는 특허 받은 소금 침전 방법을 사용합니다. 이 키트 시리즈는 혈액, 고정 조직, 식물, 효모, 곤충 등 다양한 시료 유형을 포괄하며 손실을 최소화하면서 단 30분 만에 높은 수율의 핵산을 얻을 수 있습니다.
Epicentre의 수석 제품 관리자인 Cristine Kinross에 따르면 이 키트를 사용하면 사용자는 시퀀싱이나 기타 분자생물학 응용 분야를 위한 샘플 준비 전에 추가 정제를 수행할 필요가 없습니다. 제거해야 하는 독성 화합물을 도입하지 않고 단백질 및 기타 세포 잔해를 제거하므로 여러 번의 세척이 필요 없고 핵산 수율이 향상됩니다.
Kinross는 "MasterPure를 사용하면 회수된 핵산의 순도가 뛰어나 샘플을 시퀀싱 라이브러리 준비에 직접 입력할 수 있습니다. 물론 마이크로어레이, qPCR 및 클로닝을 포함한 다른 애플리케이션에도 적합합니다."라고 말했습니다. 또한 본 키트는 RNA 정제에도 사용할 수 있습니다. 전체 핵산을 얻은 후 DNase를 처리하면 전체 RNA를 얻을 수 있습니다.
다양한 키트
Promega는 여러 가지 전략을 사용하는 광범위한 핵산 정제 키트를 제공합니다. 예를 들어, Wizard® 게놈 DNA 정제 키트는 고전적인 침전 방법을 기반으로 하며 전혈, 조직 배양 세포, 동물 및 식물 조직, 효모 및 박테리아에서 게놈 DNA를 추출할 수 있으며 이는 유연하고 효율적입니다. 키트는 간단하고 빠른 컬럼 추출 방법을 사용합니다. 또한 Promega는 자기 비드 기반 정제 키트도 제공합니다.
Promega의 유전체학 글로벌 제품 관리자인 Eric Vincent는 "용액의 정확한 구성은 다양하지만 용해, 결합, 세척 및 용출의 기본 과정은 다양한 결합 방법(예: 실리카겔 또는 셀룰로오스), 다양한 정제 형식(정제 컬럼 또는 자기 비드), 수동 및 자동 정제 작업(FFPE 샘플 등)의 경우 일부 특수 작업 또는 처리도 필요합니다.
“우리는 다운스트림 반응을 억제하는 물질을 효과적으로 제거하는 고유한 결합/세척 버퍼를 개발했으며, 최적화된 시스템을 통해 연구자들은 소량의 핵산을 포착하여 소량(30μl 미만) 용출로 전달할 수 있습니다. 우리는 또한 다양한 시약과 처리량에 적합한 자동화 솔루션을 개발했습니다."라고 Vincent는 말했습니다.
이러한 키트는 용출액에 억제제 잔류물을 방지하면서 극소량의 핵산 용출을 위한 완벽한 솔루션을 제공합니다. 이러한 키트로 정제한 후 핵산은 PCR, Sanger 시퀀싱, 차세대 시퀀싱, 칩 등 다운스트림 분석에 사용할 수 있습니다.