1. 법적 지위가 다르다: 영업허가증을 가진 기업은 국가가 인정하고, 독립법인격을 가지고 있으며, 독립적으로 경제활동을 하고, 계약을 체결할 수 있다. 지적재산권을 보유한 기업은 지적재산권을 주업으로 하지 않으며, 그 법적 주체의 지위는 지적재산권을 소유하거나 소유하지 않기 때문에 변하지 않는다.

2. 경영 모델이 다르다: 영업허가증을 보유한 기업은 주로 각종 시장 거래에 종사하며, 업무 범위가 광범위하며, 지적재산권을 보유한 기업은 대부분 지식자산으로 구성된다.

3. 권리 보호 방식이 다르다. 영업허가증을 가진 기업은 경제분쟁에 직면할 때 법원이나 중재기관을 통해 문제를 해결하고, 지적재산권을 가진 기업은 지적재산권 침해를 당할 때 특허, 상표법 수단을 이용해 자신의 권익을 보호한다.