달리 플라보노이드는 일반적으로 페놀 수산기가 있는 벤젠 고리 두 개가 중심 세 개의 탄소 원자를 통해 서로 연결된 일련의 화합물을 가리키며 각종 식물에 광범위하게 존재한다. 일반적으로 식물명으로 명명한 화합물은 서로 연결된 화합물이 아니라 특정 구조를 가지고 있다. 예를 들어, 레몬알데히드와 향모알데히드의 골격 구조는 비슷하고 향기는 비슷하지만, 위에 열거한 플라보노이드와 같은 화합물의 대체기 구조는 다르다.