소위 미생물 (Microecology) 은 주로 동물의 장에 사용되지만, 현재 식물과 수산물에 점점 더 많이 사용되고 있으며, 응용 범위가 점점 더 넓어지고 있다. 이 미생물들은 주로 프로바이오틱스를 가리킨다. 전통적으로 유산균으로 대표되는 장균군을 주로 가리키며, 물론 효모균도 포함된다. 예를 들면 사료로 쓰이는 마른 풀나물 포자균 등이다. 하지만 실제로는 다른 생물에서 사용되며, 이 프로바이오틱스의 참고균도 변한다. 같은 균주는 다른 생물에게 특이하고, 자신에게 유리하며, 병을 일으킬 수도 있다. 많은 프로바이오틱스도 조건부 병원균이다.

우열을 확정하는 가장 좋은 방법은 다른 동물에게 생리실험을 하는 것이다. 예를 들면 장모막 성장 관찰, 정식실험 등이다. 미생물학의 코흐 원리 실험 설계도 있습니다. 너의 문제는 비교적 막연하다. 예를 들어 산란계의 경우 산란량과 달걀 껍질 칼슘을 분석 할 수 있습니다. 육류를 생산하는 경제동물의 경우 육류비를 분석할 수 있다. 가축과 가금류의 경우 사료 배설물, 똥의 점도, 프로바이오틱 프로테아제, 피타 아제, 셀룰로오스의 효소 생산 능력 등이 있다. 육류비 외에 정수능력을 지표 중 하나로 삼을 수 있는데, 지표는 비교적 구체적일 것이다. 너에게 도움이 되었으면 좋겠다.