하건국 교수는 주로 수생경제동물병 통제 이론과 핵심 기술 연구에 힘쓰고 있다. 최근 과학기술부 국가과학기술지원계획, 국가' 863' 계획, 국가중점 기초연구개발계획 (973 계획), 국가자연과학기금 등 국가 및 성부급 부처과학프로젝트 40 여 개, 농업부 새우 현대산업기술체계 수석과학자, 국가공익성 산업 (농업) 전문' 새우양식관리정보시스템 설립 및 적용' 을 주관했다. 최근 몇 년 동안, 그는 건국 교수가 이끄는 연구팀이 새우 바이러스병 종합 예방 치료, 무지개 바이러스 발병기 및 예방 기술, 무지개 바이러스와 신경괴사 바이러스 백신 개발, 수산물 안전기술 지원체계 연구, 시범, 보급 응용 등에서 중요한 진전을 이루었다. 그 성과는 광둥 () 성 과학기술 특등상 1, 광동성 과학기술 1 등상 1, 교육부가 지명한 국가과학기술진보 1 등상 1, 국내외 잡지에 논문 200 여 편 발표, SCI 에는 논문 90 여 편 포함, 국가 신청 등의 성과를 거뒀다.