광학 거울 수준의 원위치 교잡과 전자 현미경 수준의 원위 교잡의 차이는 프로브 마크와 검출 방법의 차이에 있다. 표기된 핵산 탐침으로 분자교배를 통해 특정 뉴클레오티드 서열이 염색체나 세포에서 어디에 있는지를 결정하는 방법을 원위치 교배라고 한다. 차이점은 프로브 마크가 다르다는 것입니다. 전경의 제자리 교배는 광경에서 방사성 동위원소 또는 형광소 표지를 바이오틴과 같은 일부 생물 소분자로 대체하는 탐침이다. 동시에 검출 방법도 다르다. 전자현미경 아래 교잡반응의 검출은 친화소 항체 에 연결된 콜로이드 골드 알갱이를 통해 나타나고, 핵산의 존재는 광학현미경 바로 아래에 나타난다.