원자 구조의 특징은 물질의 성질과 화학 반응에서의 행동을 결정할 수 있다. 예를 들어, 원소의 원자 구조는 전하, 원자량, 핵외 전자의 배열을 결정하여 물질의 화학적, 물리적 성질에 영향을 미친다. 예를 들어, 산소 원자에는 6 개의 외층 전자가 있는데, 다른 원자와 반응할 때 두 개의 전자를 받아 O2- 이온을 형성하는 경향이 있기 때문에 산화작용이 있다. 나트륨 원자는 외층 전자가 하나밖에 없다. 이 전자를 잃으면 양전기가 있는 이온 Na+ 가 되어 환원작용이 있다. 동시에, 서로 다른 원소 사이의 전자 구성은 또한 그들의 원자 반경과 화학 결합의 형성을 결정한다.
또한 원자 구조는 화학반응의 속도와 방향, 산물의 종류와 수량 등에 중요한 영향을 미친다. 예를 들어, 전자의 수가 다른 산소 원자와 질소 원자는 아미노산 합성에서 반응률이 다르기 때문에 산물의 종류와 양에 영향을 미친다.
요약하면 원자 구조는 재료의 성질을 결정하는 데 매우 중요하며 원자의 내부 구조와 특징을 이해하는 것은 화학적 성질과 재료의 성질을 이해하는 데 중요한 의미가 있다.