치주병 초기에도 잇몸염이었을 때 염증은 잇몸 조직을 침범했을 뿐 치주 조직을 손상시키지 않고 기본적으로 치료할 수 있었다. 이를 씻어서 국부적인 자극물을 제거하면 염증이 사라지고 잇몸이 건강해진다.
치주병이 치주염으로 발전하면 염증이 치주 지원 조직을 파괴해 잇몸이 위축되고 잇몸뼈가 흡수된다. 이런 파괴가 일단 발생하면 되돌릴 수 없기 때문에 치료할 가능성은 비교적 적다. 치료는 단지 병세를 통제하고 현 상태를 유지하는 것, 즉 치주병의 악화를 최대한 방지하는 것이다.
치주병 자체의 재발률이 높아 치료하기 어렵다. 레이저를 치주 보조 치료로 사용하면 재발을 효과적으로 줄일 수 있다. 레이저의 절단 기능은 잇몸주머니와 잇몸주머니 안의 염증 상피를 제거하고 살균 소염지혈을 할 수 있다. 전통적인 수술에 비해 레이저는 내성이 좋고, 마취가 없고, 출혈이 적고, 회복이 빠르다는 장점이 있다. 레이저는 일부 치주 수술의 대안으로 쓰일 수도 있고, 기초 치주 치료 후 보조조치로 쓰일 수도 있다. 예를 들어, 잇몸 아래 스크래치술은 레이저 잇몸 주머니와 함께 소독하고, 스크래핑 후 레이저로 잇몸 주머니 안에 남아 있는 세균 염증을 없애고, 소독이 더 깨끗하고 효과적이어서 치주병의 재발을 줄일 수 있다.