사법실천에서 의료사고 형사사건 입건난의 문제는 매우 두드러진다. 관련 법규의 불완전성, 특히 의료사고 행정처리와 사법절차 연결이 불규칙하기 때문에 형사책임을 물어야 하는 일부 사건은 소송 절차에 들어가기가 어렵거나 사건 입건 후 오랜 기간 지속되는 국면에 빠진다.