1. 모니터링 범위는 다르다. 생태유량 감독은 주로 생태유량 모니터링에 중점을 두고 인간의 활동과 자연진화가 수생태계에 미치는 영향을 평가하는 반면, 수생태모니터링 범위는 수환경과 생물의 두 부분을 포괄하며 수질뿐만 아니라 생물다양성과 생태계 구조와 기능에도 관심을 기울이고 있다.
2. 목적은 다르다: 생태유량감독은 수력발전소 생태유량의 파견 관리와 주관부의 감독 관리의 필요성을 보장하는 데 중점을 두고 수력발전소의 생태균형과 지속가능한 발전을 유지하는 데 중점을 두고 있으며, 수생태모니터링은 인류활동과 자연진화가 수생태계에 미치는 영향을 평가하는 것을 목표로 한다. 환경보호, 생태복구, 지속가능한 발전을 위한 의사결정 근거를 제공하다.