에도가와 코난의 본명은 쿠도 신이치로, 검은 옷을 입은 조폭들의 활동을 조사하던 중 강제로 독약을 먹게 되어 초등학생 수준으로 몸이 작아진 인물이다. 몸을 원래대로 되돌리고 갱단을 유인해 해독제를 찾기 위해 자신의 정체를 숨기려던 어느 날, 우연히 <에도가와 란포>의 전작을 보게 된다. 아가사 박사의 집 책장, 그리고 아버지도 '코난 도일'의 팬이었기 때문에 '에도가와 코난'이라는 이름 아래 자신의 정체를 숨기고 싶은 마음이 들었습니다. 그리고 그의 여자친구 Xiaolan의 집에 살면서 그를 움츠러들게 만든 흑인 남자들을 찾으려고 노력했습니다. 또 요시다 아유미 등을 만나 젊은 탐정단을 결성한다. 그리고 오사카 고등학교 탐정 핫토리 헤이지와 좋은 친구가 되었다. 마약 디자이너와 그도 작아진 뒤 그레이 멤버 아이도 합류했다.