에도가와 코난의 본명은 쿠도 신이치로, 검은 옷을 입은 조폭들의 활동을 조사하던 중 강제로 독약을 먹게 되어 초등학생 수준으로 몸이 작아진 인물이다. 몸을 원래대로 되돌리고 갱단을 유인해 해독제를 찾기 위해 자신의 정체를 숨기려던 어느 날, 우연히 <에도가와 란포>의 전작을 보게 된다. 아가사 박사의 집 책장, 그리고 아버지도 '코난 도일'의 팬이었기 때문에 '에도가와 코난'이라는 이름 아래 자신의 정체를 숨기고 싶은 마음이 들었습니다. 그리고 그의 여자친구 Xiaolan의 집에 살면서 그를 움츠러들게 만든 검은 옷을 입은 남자들을 찾으려고 노력했습니다. 또 요시다 아유미 등을 만나 젊은 탐정단을 결성한다. 그리고 오사카 고등학교 탐정 핫토리 헤이지와 좋은 친구가 되었다. 드럭 디자이너도 사이즈가 줄어든 뒤, 그레이 멤버인 아이도 합류했다.