合肥16所。

1、工资。合肥16所又称中国电子科技集团公司第十六研究所，员工的工资为16000元，而38所也就是中国电子科技集团公司第三十八研究所，员工的工资为14000元，合肥16所的工资更高，所以更高。

2、福利。合肥16所为员工缴纳五险一金，并且节假日礼品非常丰富，而合肥38所只有五险一金，合肥16所的福利更少。