废水处理系统采用固液分离提取饲料，厌氧处理制取沼气，好氧处理达标排放的技术路线。厌氧处理前的固液分离采用XM80/800-u型板框压滤机，所得滤渣含水率为75%左右，经烘干成为DDG蛋白饲料。滤液中由于大部分悬浮物(90%以上)被去除，使COD的质量浓度降至25000mg/L，BOD的浓度降至6000mg/L，SS的质量浓度降至2500mg/L。出水30%(约300m3)回用酒精车间拌料。

厌氧处理采用新型高效的厌氧复合床反应器(UBF)，进水用该厂部分低浓度废水调节。设计温度为35-38℃；设计流量1200m3/d；进水COD的质量浓度为18 000-20 000mg/L；去除率85%-90%；反应器单体直径8m，总高度12m，有效容积500m3；污泥悬浮层高度为2m；填料层2m；填料层和三相分离器的间隔高度设计为1m；三相分离器和排水高度设计为4m；UBF中安装YDT弹性立体填料。

UBF反应器的启动是整个工程能够顺利运行的关键。首先就是接种污泥的性质，本工程中不管是采用性质相似的厌氧污泥还是好氧污泥(来自二沉池)，均能将UBF成功启动且形成颗粒污泥。但是，用好氧污泥，所需时间长，形成的颗粒污泥小。接种污泥浓度不低于10kg[VLSS]/m3。本工程UBF反应器启动过程分成2个主要阶段进行：①采用低浓度进水且保持进水浓度不变，逐渐增加进水量以提高有机负荷直至达到设计进水量；②保持进水量不变，逐渐增加废水浓度以提高有机负荷直至达到设计进水浓度。当UBF反应器达到了设计的水质水量，反应器中形成颗粒污泥则进人稳定运行期。

好氧处理采用周期循环活性污泥法(CASS)技术。原设计CASS的运行周期是4h，其中曝气2h，沉淀1h，排水1h。调试过程中发现厌氧出水浓度比设计浓度低，经过调整，运行采用限量曝气方式，进水4h，然后曝气2h，沉淀1h，排水1h。出水达到国家《污水综合排放标准》GB8978-1996酒精工业二级排放标准。