线路图见右边，粉色的线为13号线。

按照规划，工程将分三期进行。

现开通金运路站、金沙江西路站、丰庄站、祁连山南路站、真北路站、大渡河路站、金沙江路站、隆德路站、武宁路站、长寿路站、江宁路站、汉中路站、自然博物馆站、南京西路站、淮海中路站、新天地站、马当路站、世博会博物馆站和世博大道站。

轨道交通13号线一期工程设北翟路车辆基地1座（与2号线***享），设控制中心1座（与11号线***享）和变电所1座（与11号线***享），轨道交通13号线一期西段（工程于2012年年底首先开通）。

上海轨道交通13号线是上海市城市轨道交通路网规划中的一条纵贯中心城区的“西北——东南”轴向的直径线，也是轨道交通路网中的一条重要的主干线。 上海轨道交通13号线一期工程线路正线全长为全长16.4公里，起点为金运路站，到达一期工程终点长寿路站，线路途经嘉定、普陀、静安3个行政管辖区。

轨道交通13号线一期工程***设10座车站，沿线与3、4、7、11***4条线、3座站换乘，全部为地下站，分别是金运路站、金沙江西路站、丰庄站、祁连山南路站、真北路站、大渡河路站、金沙江路站（与3、4号线换乘）、隆德路站（与11号线换乘）、武宁路站、长寿路站（与7号线换乘）。 三期串联了张江高科园区、张江大型居住区等客流集散点，其起点位于二期工程终点站世博大道站，***设长清路站、成山路站、东明路站、六里站、下南路站、北蔡站、绿川新村站、莲溪路站、华夏中路站、中科路站、哥白尼路站、张江路站。列车编组的初、近、远期都采用A型车6卡编组，运营时间从5:00至23:00，***18小时。初期全日开行列车218对，后期全日开行252对，远期全日开行280对。计划2015年开工，2017年建成试通车，工程建设总工期约3.5年。

横穿上海市中心

13号线是上海市城市轨道交通路网中西北－东南的重要骨干线路，穿越嘉定区、普陀区、静安区、黄浦区、和浦东新区5个行政区，经过金鹤公路、金沙江路、长寿路、天目西路、恒丰路、石门路、瑞金二路、成山路、沪南路等客运交通走廊和大型客流集散点，串联城市总体规划中的几个中心，如长风地区、华阳社区、江宁社区、不夜城综合开发区、太平桥二期和部分历史文化风貌保护区、世博会地区以及浦东的三林、六里地区。

13号线全长33.6公里，均为地下线，***设31座车站。分别为金运路站（换乘20号线）、金沙江西路站、丰庄站、祁连山南路站（换乘21号线）、真北路站、大渡河路站（换乘15号线）、金沙江路站（换乘3、4号线）、隆德路站（换乘11号线）、武宁路站（换乘14号线）、长寿路站（换乘7号线）、江宁路站、汉中路站（换乘1号线、12号线）、自然博物馆站、南京西路站（换乘2号线、12号线）、淮海中路站、新天地站（换乘10号线）、马当路站（换乘9号线）、世博会博物馆站、世博大道站、长清路站（换乘7号线）、成山路站（换乘8号线）、东明路站（换乘6号线）、六里站、下南路站、北蔡站、绿川新村站、莲溪路站（换乘18号线）、华夏中路站（换乘16号线）、中科路站、哥白尼路站和张江路站（换乘24号线），均为地下站。

据环评报告透露，13号线将分段修建，预计全线工程总投资为198.68亿元，2012年底将完成金运路站至金沙江路站线路，设车站5座；2014年完成金沙江路站至长寿路站线路，2015年完成长寿路站至世博大道站线路，2017年完成世博大道站至以张江路站。

世博专用线

13号线其中三个车站（马当路、世博会博物馆（原卢浦大桥站）、世博大道）三个全长约5公里的地铁隧道区间，属于2010年世界博览会的世博专用线（或称世博过江段），计划2010年初提早投入运营，以便开幕前建成启用，作为世博园内专用轨道交通。在世博会期间此段线路将不纳入轨道交通运营网络，而是凭世博会门票免费乘坐。 此区间由上海建工（集团）总公司于2007年3月以13.38亿元人民币的投得建设权；工程竣工并试运营一年后，则会由招标人回购。