乙醛酸循环在乙醛酸体进行。

乙醛酸循环是植物细胞内脂肪酸氧化分解为乙酰CoA之后，在乙醛酸体内生成琥珀酸、乙醛酸和苹果酸；此苹果酸可用于糖的合成的过程。动物和人类细胞中没有乙醛酸体，无法将脂肪转变为糖。植物和微生物有乙醛酸体。油料植物种子萌发时存在着能够将脂肪转化为糖的乙醛酸循环。水稻盾片中也分离出了乙醛酸循环中的两个关键酶异柠檬酸裂解酶和苹果酸合成酶。

反应过程：脂肪酸经过β-氧化分解为乙酰CoA，在柠檬酸合成酶的作用下乙酰CoA与草酰乙酸缩合为柠檬酸，再经乌头酸酶催化形成异柠檬酸。随后，异柠檬酸裂解酶将异柠檬酸分解为琥珀酸和乙醛酸。再在苹果酸合成酶催化下，乙醛酸与乙酰CoA结合生成苹果酸。苹果酸脱氢重新形成草酰乙酸，可以再与乙酰CoA缩合为柠檬酸，于是构成一个循环。

乙醛酸循环特点和意义：

乙醛酸循环和三羧酸循环中存在着某些相同的酶类和中间产物。但是，它们是两条不同的代谢途径。乙醛酸循环是在乙醛酸体中进行的，是与脂肪转化为糖密切相关的反应过程。而三羧酸循环是在线粒体中完成的，是与糖的彻底氧化脱羧密切相关的反应过程。油料植物种子发芽时把脂肪转化为碳水化合物是通过乙醛酸循环来实现的。

乙醛酸循环实现了脂肪到糖的转变，对植物的生长发育起着重要的作用。乙醛酸循环提高了生物体利用乙酰-CoA的能力。只要极少量的草酰乙酸做引物，乙醛酸循环就可以持续运行，不断产生琥珀酸，为TCA回补四碳单位。