党委办公室:
具体负责全院党的建设、精神文明建设、宣传思想工作、组织人事工作、纪检监察工作、统战工作、群众工作、老干部工作等。
院办公室:
协调院内行政事务;编制事业发展规划;负责文件收发、文稿校核、信息发布、信访接待以及物资采购管理;提供后勤保障。
高等学校招生办公室:
综合管理本市普高、成高、高职校和研究生的考试考务、招生录取工作;行使教育行政主管部门政策制定后的操作执行职能,对区、县高招办进行业务指导,对高校招生工作实行全程业务的管理和监督。
中等学校招生办公室:
指导、协调本市初中毕业生统一学业考试考务和招生录取工作;对区、县中招办和招生学校进行招生业务指导及统筹协调工作。
社会考试办公室:
承担教育部、市教委及有关部门交办或委托的各类非学历证书考试;负责对部分考试项目的培训机构和考点进行业务管理。
高等教育自学考试办公室(上海命题中心):
行使省市级自考办职能,综合管理本市高等教育自学考试工作。
命题办公室:
负责本市高考、中考、“三校生”高考等主要教育招生考试的命题工作。
教育招生考试研究所(筹):
承担并组织相关科研项目的研究与立项评审、科研成果的管理工作;编发教育招生考试的学术书刊和研究资料;开展与境内外考试机构的合作研究和学术交流。
网络信息中心:
负责全院的计算机网络和办公自动化工作;管理考试院网站;落实院信息化建设的各项任务。
财务室:
执行财务制度,负责全院财务管理、会计核算、预决算编制和财务分析,以及各类考试收费立项的申报。