两者的区别是分子式不同、变色域不同。

1、分子式不同：百里香酚酞是一种天然酚酞类化合物，是由香茅属植物百里香中提取而得，它的化学结构包含苯环和酚环，并且具有多个羟基。酚酞则是一类合成化合物，其化学结构中只有一个酚环，并且只有一个羟基，百里香酚酞的结构更加复杂。

2、变色域不同：酚酞是8.2（浅红色）至10.0（红色），百里香酚酞是pH9.3（无色）至10.5（蓝色）。