丙酮酸和甘醇酸的区别是化学结构不同和在生物体内的代谢途径和作用不同。

1、化学结构不同，丙酮酸是一种无色液体，化学式为C3H4O3，是α-酮酸中最简单的一种，具有酸性。甘醇酸是一种有机酸，也称为羟基乙酸，化学式为C3H6O3。

2、在生物体内的代谢途径和作用不同，丙酮酸是一种代谢产物，在人体内能够通过某些途径转化为能量。甘醇酸是糖代谢的重要中间产物之一。它在生物体内的代谢中发挥着重要作用，能够产生大量的ATP能量，参与细胞的呼吸过程。