北京化工厂的前身为高崇熙于1950年创建的北京新华化学试剂所，1952、1953年先后与上海一心化学厂、北京中华企业公司等合并为北京化学试剂研究所（在北就西郊），至1956年又相继并入39个中小型化工厂，成为北京化学试剂厂，1958年迁至现址，改名为北京化工厂。北京东郊和通县的北京化学试剂二厂和北京化学试剂三厂与北京化工厂组成北京化学试剂总厂。