杀蓝藻最好的办法有加大增氧力度、合理投喂，勤改底、投放滤食性鱼类、泼洒无机磷、投放活性炭。

1、加大增氧力度

蓝藻喜欢相对静止的水体，通过安装增氧设备搅动水体，阻止水体分层，达到水体流动、同时增氧的目的，增氧能促进水体有机质分解，缓解藻毒素，使其他藻类繁殖。

2、合理投喂，勤改底

养殖中后期，高密度养殖环境下随着投饵量增加会导致池塘底部产生大量残饵、粪便，造成池塘底部污染，使池塘富营养化导致蓝藻暴发，建议使用“底居安”加强型5-7天改底一次，降低池塘底部污染。

3、投放滤食性鱼类

可在水中投放鲢鱼、鳙鱼、罗非鱼等滤食性鱼类，能有效地缓解蓝藻进行繁殖，蓝藻类食物是鲢鱼、鳙鱼等鱼种的食物，经过实践证明鲢鱼、罗非鱼、鳙鱼等滤食性鱼类，可以有效的缓解蓝藻的生长。

4、泼洒无机磷

通过泼洒无机磷来改变水中氮磷的比例，加速硅藻、绿藻等有益藻类的快速生长，来缓解蓝藻的繁殖。水塘中氮磷含量过低、过高，都会导致蓝藻爆发性的生长。

5、投放活性炭

往环境中投放适量的活性炭，活性炭具有较强的吸附能力，对于藻类所产生的毒素具有较强的吸附效果。但是水体中的有机物会影响活性碳的吸附力，使用后回收困难，处理成本很高。