按整体结构划分，马桶可以分为分体式，连体式，挂墙式和无水箱马桶。

分体式：分体式坐便器是水箱与底座分开的坐便器，由于其水箱与底座分开烧制，不浪费烧制空间，成型率能达到90%以上，因此价格相对较低。分体式坐便器一般采用冲落式下水，水位高，冲力大，相对来说不易堵塞，但冲水噪音也大于其他类型的马桶。分体式坐便器造型比较传统，外观。同时占用空间大，不容易靠墙，水箱与底座之间的缝隙会形成卫生死角，不易打理，容易容纳污渍甚至产生霉变，影响美观和卫生。独立的水箱对水件的要求也更高，水件质量差、密封圈老化等都会导致水箱连接处漏水的问题。

连体式：连体式马桶算是分体式马桶的改进产品，其水箱与底座整体烧制，不可单独分开。由于烧制体积增大，故其成型率较低，只能到达60%-70%，所以相对于分体式坐便器的价格要高一些。

无水箱马桶：无水箱马桶是一种不设水箱，采用城市自来水直接冲洗的新型节水型马桶。这种马桶充分利用城市自来水水压并应用流体力学原理完成冲洗，相比之下更为节水，同时也对水压有一定要求。由于没有水箱，在节省空间的同时也避免了水箱里水的污染和倒流问题，比较卫生，便于清洁。无水箱马桶通常为一体式设计，外形豪华典雅，同时融合了诸多科技元素，功能齐全，能给使用者带来全面的舒适体验。但由于技术和价格的原因，消费者还没无法接受。

壁挂式：挂墙式坐便器最早起源于欧洲国家，是由隐蔽式水箱和坐便器组合而成，欧杰特隐藏式水箱近几年逐渐在国内流行起来。挂墙式马桶背后要砌假墙，全部管线全部封在假墙中，节省空间，方便打扫都是其优点，同时有了墙体的阻隔，冲水噪音也会明显降低。