所谓“保税仓”都是指没有经过进口清关的、受海关监管的仓库——无论是在保税区还是在自贸区，抑或是在保税区或自贸区之外。

由此可知，进口料件能够入到自己厂家的仓库，那么一般都是清关后（除非工厂的仓库被批准为“保税仓”）。而在“保税仓”存放的货物，则是没有清关并由海关监管的货物。换句话说就是，进出保税仓的货物必须经过海关同意或监督，或者在办理完清关手续后才能够出仓。

那么，清关完税后的货物进出仓库手续简单，而进出“保税仓”的手续麻烦许多——这是二者主要区别。另外就是考虑二者仓储费的成本问题。