质量标准不同，价格不同。

1、根据查询仪器信息网显示，质量标准：进口乙腈遵循更为严格的质量标准，纯度和稳定性更高，而国产乙腈的质量标准有所不同，导致流动相的稳定性和纯度也有所差异。

2、价格：进口乙腈的价格高于国产乙腈，因此在使用进口乙腈配制流动相时需要考虑到成本问题。