酶标仪和分光光度计的区别主要在两个方面:一是用于比色的容器的区别。分光光度计使用的容器是比色皿，酶标仪使用的容器是微孔板。微孔板通常由透明的聚乙烯材料制成，对抗原和抗体有很强的吸附作用，用作固相载体。二、入射光的差异。测试时，分光光度计的入射光束横向和纵向穿过待测溶液和比色皿，而酶标仪的装有比色溶液的多孔板是多排的，因此只有酶标的光束部分纵向穿过固定液和微孔板，光束可以从下向上或从上向下穿过比色溶液。