两种杀菌机结构的区别是内部构造不同。

据头条百科消息，浸水式杀菌机外壳是采用304/316不锈钢材质，包括杀菌釜、水管、两个导向板、釜盖、两个关盖机构、两个压紧缸、翻转机构和杀菌筐，杀菌釜的内部设置有杀菌腔室，杀菌腔室中设置有加热器。

淋水式杀菌机由锅体、锅盖、开启装置、锁紧楔块、安全联锁装置、轨道、灭菌筐、蒸汽喷管及若干管口等组成。锅盖密封采用充气式硅橡胶耐温密封圈，密封可靠，使用寿命长。