这两种药品的区别有：成分不同、功效不同。

成分不同：阿维菌素是16元大环内酯化合物，伊维菌素则是半合成大环内酯多组份抗生素。

功效不同：阿维菌素是一种被广泛使用的农用或者是兽用杀虫刹、杀螨刹。伊维菌素是新型的广谱、高效、低毒抗生素类抗寄生虫药，对体内外寄生虫特别是线虫和节肢动物均有良好驱杀作用，但对绦虫、吸虫及原生动物无效。