有三个校区。根据金陵汇文中学官网显示,初中部有三个校区,分别是南苑校区、江宁校区和骆马湖校区。金陵汇文初中部的三个校区都配备了先进的设施和师资力量,并提供多种多样的教育课程和活动项目,为学生提供了良好的学习和发展平台。