纳他霉素用于食品中，可能存在破坏肠道微生物稳态、过敏等危害。纳他霉素是一种近乳白色或淡黄色的粉末状结晶，无臭无味，是一种微生物菌种添加剂，可以增加食品保存期，成本也比较低，通常安全系数较高，但也不排除会对身体造成不良影响。

1、破坏肠道微生物稳态：纳他霉素不易被系统消化、吸收，而且人体微生物群落对其抵抗性不高，所以过量食用纳他霉素可能会破坏人体肠道微生物稳态，导致便秘、腹胀、腹痛、腹泻等症状；

2、过敏：纳他霉素是一种菌落，部分人群可能存在过敏现象，容易出现荨麻疹、丘疹等皮肤损害，严重可导致出现喉头水肿、呼吸困难、过敏性休克等不良反应；

3、其他危害：由于纳他霉素存在溶解性不佳的短板，一般也只在食物的表面作防腐剂，如果食物内部已经被霉菌侵染，而外部处于完好无损的状态，此类内部出现腐烂、变质等情况的产品被购买后，极易被人误食而引起食物中毒，导致安全风险隐患增高