材料性质不同，用途不同。

1、材料性质不同：半透膜是一种只允许某种指定分子或离子通过的薄膜，具有选择性透过性，其孔隙的大小比离子和小分子大，但比生物大分子如蛋白质、淀粉等小，而滤纸是一种多孔的过滤材料，其上有许多微小的孔隙，可以允许液体、气体等微小颗粒通过。

2、用途不同：半透膜常用于胶体等颗粒的过滤，能筛选出小于其孔径的物质，如蛋白质、淀粉等，而滤纸则常用于实验室或工业生产中的液体过滤，能去除液体中的微小颗粒、杂质等。