点样端放在负极。因为泳动方向是从负极向正极的。

做DNA电泳和蛋白质SDS-PAGE电泳的时候，加样孔都位于负极。因为这两种情况下，样品都带负电荷，在电场中将向正极泳动，所以点样端要置于负极。

醋酸纤维素薄膜电泳的时候用的膜是有两面的，点样面是有醋酸纤维素的，看起来是粗糙的，导电，而反面是光滑的，不导电。把点样面朝下，搭在盐桥上才能构成通路，蛋白才会发生电回泳。当然要注意点样线不能碰到盐桥上的纱布，不然样品答会被纱布吸走。