该快递公司总部在上海。

根据申通官网发布显示，申通快递创建于1993年，于1996年在南京、苏州等地开设网点公司。该快递的总部位于上海市青浦区赵重公路，截止2023年，申通快递已完成线上线下结合、向智能化迈进、全面云上的战略模式。