由于棉籽饼、粕中游离棉酚对动物有害，因此，在使用棉饼、粕时，要根据饲喂对象及饼、粕中游离棉酚的含量加以限量。反刍家畜在有优质粗料及多汁青料的情况下，棉籽饼、粕的用量不受限制，不会造成中毒。对单胃动物要限制喂量，最好使用经过脱毒处理的棉籽饼、粕。其脱毒方法很多，如水煮法、硫酸亚铁处理法、碱处理法、浸提法等。其中以硫酸亚铁法最简单，脱毒效果亦好。肉用鸡饲料应少用含壳多的棉籽饼、粕，以免影响生长，鸡对棉酚的耐受力高于猪，但蛋用鸡饲喂棉籽饼、粕会造成鸡蛋在贮存期间发生变色反应，即蛋白呈现粉红色，蛋黄呈现绿黄或暗红及斑点状。种畜苗应避免使用，以免影响繁殖性能。同时，使用棉籽饼、粕配制饲粮要注意氨基酸平衡，尤其是棉籽饼、粕的赖氨酸含量低，且利用率差，应注意添加赖氨酸。

农村育肥牛专业户用棉籽饼喂牛十分普遍，有的农户饲料中棉籽饼的含量达到了30%，由于使用过量或方法不当，使牛中毒的病例时有发生。因此应注意以下几点：

一、适量饲喂棉籽饼质优价廉，蛋白质含量高等，不失为一种好饲料，但饲料中的含量不宜过多，一般不超过15%为好，否则易中毒。

二、脱毒处理较为简单的一种处理方法是将棉籽饼在清水中浸泡1小时，然后放入锅中蒸煮，煮沸1小时后捞出，晾凉后饲喂。煮棉籽饼的水应倒掉，不要喂牛。

三、间隔使用由于棉籽饼是蓄积中毒，最好是间隔使用，如喂半月停半月，使体内蓄积的毒素排出，以防中毒。

四、治疗牛中毒后要立即停喂棉籽饼，用0.3%～0.5%高锰酸钾溶液或2%的碳酸氢钠溶液1000～2000毫升进行洗胃。洗胃后，可灌服硫酸钠500克或石腊油1000毫升，以加快毒素的排除。另外可根据病情进行输液，强心、消炎、保肝等对症治疗。