1、按照洁净等级划分，也就是按照灰尘、细菌的数量多少划分，美国联邦209E标准，分为十级、百级、千级、万级、十万级；GMP制药标准，分为ABCD四个级别；按照国际ISO14644标准，分为1-9级。

2、按照洁净室内的气流状态，分为单向流（层流）、非单向流（乱流）两种。单向流的空气一般是从上到下保持一致的，百级、十级一般用这种方式。千级、万级、十万级一般用非单向流。

3、按照需要控制的悬浮粒子的性质，划分为工业洁净室和生物洁净室。工业洁净室主要控制灰尘。生物洁净室还要控制细菌。