上海崇明南门5家医疗器械厂。根据查询相关资料信息显示，上海崇明南门5家医疗器械厂，分别为晟盟医疗器械有限公司、盼胜医疗器械有限公司、盛济医疗器械有限公司、达华医疗器械有限公司、惠远医疗器械有限公司。