어떤 사모기금은 회사제에 따라 운영되고, 회사제 사모투자기금은 법인기금이다. 일반 주주는 투자자이며, 투자의 최종 의사결정자이며, 각각 출자 비율에 따라 의결권을 분배한다. 회사제 모델의 장점은 명확하고 이해하기 쉬우며 투자자들이 더 쉽게 받아들일 수 있다는 것이다.

일부 사모기금은 신탁제도에 따라 운영된다. 즉, 사모지분신탁투자는 신탁회사가 신탁계획에 따라 받은 자금을 주식에 투자하는 것을 말한다. 신탁제도 운영 모델을 채택하는 장점은 신탁플랫폼을 통해 대량의 자금을 신속하게 집중해 자금 확대의 역할을 할 수 있다는 점이다. 그러나 신탁업의 효과적인 등록제도 부족과 같은 단점도 있다.

한정된 파트너십을 채택할 수도 있고,' 돈, 공헌이 크다' 와 같은 유한한 파트너십제의 장점을 분명히 드러낼 수도 있다. 운영상, 유한협력기업은 관리회사에 자금을 맡기지 않고, 일반 파트너가 직접 자산을 관리하고 기업사무를 경영한다. 그 장점은 파트너에게만 세금을 부과하고 이중 과세를 피한다는 것이다.

"회사+유한파트너십" 모델은 주식투자기금이 가장 많이 사용하는 운영 모델이다. 여기서 회사는 펀드 매니저가 회사이고 펀드는 유한협력기업이다. 장점은 회사제가 유한책임제를 시행한다는 데 있다. 일단 펀드가 불량한 상황에 처하면 유한한 책임을 지고 있는 관리회사가 위험장벽이 되어 관리자의 개인적 위험을 줄일 수 있다는 점이다.