1. 지분 구조: 국유기업의 소유권은 국가에 속하며 합자기업의 소유권은 합자 당사자가 결정한다.

2. 경영 목표와 책임은 다르다. 국유기업의 경영 목표는 주로 국가와 사회의 이익을 위한 서비스이며, 어느 정도의 공익성을 가지고 있으며, 그 책임은 주로 국가와 사회를 위한 부와 일자리를 창출하는 것이고, 합자기업의 경영 목표는 주로 주주와 투자자를 위한 가치를 창출하는 것이며, 그 책임은 주로 주주와 투자자를 위한 보상과 이윤을 얻는 것이다.