자금 관리의 경우 철도 개발 기금은 폐쇄형 회사 기금 형식 (잠정 15) 을 채택할 예정이며, 정부가 철도 본사에 주 후원자로 위탁해 전국사회보장기금 이사회 등 신용기관과 함께 설립한다. 이 중 철도 본사는 펀드사의 보통주주로 중앙재정자금의 출자자 대표로 활동하고 있다. 다른 투자자들은 펀드사 우선주주주로 펀드사의 일상적인 경영관리에 참여하지 않는다. 펀드 운영 초기에 펀드 투자관리회사는 주로 철도 본사의 의뢰를 받았다.